胃癌是全球致死性排行第三的惡性腫瘤疾病，且由于東西方飲食生活習(xí)慣差異，以我國為首的東亞諸國發(fā)病率尤為突出。胃癌具有復(fù)雜的患者組織病理及基因組異質(zhì)性，使臨床患者分層與精準(zhǔn)醫(yī)療面臨嚴(yán)峻挑戰(zhàn)。因此，有效鑒定不同胃癌患者基因組中潛在共性特征，對指導(dǎo)臨床用藥方案、預(yù)測療效及患者預(yù)后具有重要意義。

    允英醫(yī)療攜手上海市長征醫(yī)院，基于允英自主研發(fā)的高效DNA提取技術(shù)DNAplus?、先進(jìn)液相雜交捕獲測序AllNGS?技術(shù)聯(lián)合生物信息大數(shù)據(jù)庫分析技術(shù)平臺，開展了科研攻關(guān)，并首次報(bào)告對于老年或攜帶TP53突變的胃癌患者，存在PIK3CA基因體系突變將導(dǎo)致患者響應(yīng)免疫治療的幾率提升。

    本研究總計(jì)入組了288例胃癌患者，其中男性198人（68.8%），女性90人（31.3%）?；颊咂骄挲g60歲，中位年齡61歲，男女隊(duì)列年齡無顯著性偏差。所有入組患者均提供腫瘤組織樣本，同時(shí)使用允英采血管采集并保存配對血液樣本。樣本中核酸分子經(jīng)DNAplus?提取后，采用允英AllNGS Panel 639?實(shí)體瘤全程管理產(chǎn)品，基于Illumina nextSeq550二代測序平臺在組織與配對血液樣本中檢測了與腫瘤發(fā)生、發(fā)展及患者用藥指導(dǎo)、預(yù)后評估相關(guān)的639個(gè)基因的全部外顯子與部分內(nèi)含子上所攜帶的基因胚系及體系變異。

    結(jié)果發(fā)現(xiàn)，入組患者所檢出突變基因與患者基線間相關(guān)性極為復(fù)雜，為胃癌患者基因組具有高度異質(zhì)性的論點(diǎn)提供了有力支持。值得注意的是，不同年齡段（≥60歲或＜60歲）患者間具有不同的突變背景，表明年齡可能是胃癌患者基因組圖譜鑒定的重要影響因素。此外，僅有43.8%（126人）未攜帶TP53體系突變，且其中多達(dá)41.3%（52人）的TP53野生型患者中罕見基因組體系突變，表明其腫瘤突變負(fù)荷極低，提示TP53可能是胃癌患者分層的一個(gè)潛在分子特征。

    上述結(jié)論在包含873名胃癌患者基因組信息的Cbioportal公共數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行了驗(yàn)證，證實(shí)了在以TP53突變狀態(tài)和年齡分組下，CDH1、HER2和PIK3CA與TMB的相關(guān)性。我們進(jìn)一步對35名曾接受了免疫治療的胃癌患者進(jìn)行了生存分析，發(fā)現(xiàn)在TP53突變或年齡≥60歲的患者群體中，攜帶PIK3CA突變的患者能夠更好的響應(yīng)免疫治療，患者總生存期相比非攜帶者更長、預(yù)后更好，盡管這一趨勢由于樣本量較小而未表現(xiàn)出統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性差異。