胸腺上皮腫瘤(Thymic epithelial tumors,TETs)較為罕見(jiàn),發(fā)病率約為0.13 / 10萬(wàn),但屬于最常見(jiàn)的前縱隔原發(fā)性腫瘤。胸腺上皮瘤病理分型復(fù)雜多樣,根據(jù)WHO世界衛(wèi)生組織病理分型可分為A型、AB型、B1型、B2型、B3型和胸腺癌(TC型)6種亞型,不同亞型的惡性程度迥然而異。因此,亟需從基因水平闡明各亞型異質(zhì)性,以更好的指導(dǎo)患者分層,助力精準(zhǔn)醫(yī)療決策定制。
允英醫(yī)療聯(lián)合徐州醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院為此開(kāi)展科研攻關(guān),借助于允英自主研發(fā)的DNAplus?高效DNA提取技術(shù)、AllNGS?精準(zhǔn)液相雜交捕獲技術(shù)Panel-315產(chǎn)品,繪制了中國(guó)人群胸腺上皮腫瘤的分子特征圖譜,并首次提出NFKBIA是胸腺上皮瘤患者不良預(yù)后的重要標(biāo)志及潛在治療藥物靶點(diǎn)。
本研究隊(duì)列由47名患者構(gòu)成,總計(jì)39例胸腺瘤和8例胸腺癌患者被納入研究。入組患者均提供了經(jīng)福爾馬林固定的石蠟包埋組織樣本,并使用AllNGS? Panel-315進(jìn)行了腫瘤發(fā)生、發(fā)展及用藥相關(guān)的315個(gè)基因(詳見(jiàn)產(chǎn)品簡(jiǎn)介)的全外顯子及部分內(nèi)含子靶向測(cè)序。數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)濾胚系突變后,共報(bào)告了114個(gè)基因上的178個(gè)突變。最常見(jiàn)的突變類型是錯(cuò)義突變、移碼突變和無(wú)義突變,最常見(jiàn)的突變基因是KMT2C(13%)、SPTA1(11%)、TET2(9%)、KDM6A(9%)和ATM(9%)。值得注意的是,本研究隊(duì)列中所有患者均未表現(xiàn)出微衛(wèi)星高度不穩(wěn)定特征,且存在極高比例的C > T轉(zhuǎn)變SNV(55%),這可能是胸腺上皮瘤患者的潛在特征之一。
有趣的是,本研究還發(fā)現(xiàn)胸腺癌患者突變基因數(shù)(7.3)明顯高于A/AB亞型(3.4)和B1-3亞型(2.7)的胸腺瘤患者,且不同亞型的高頻突變基因譜存在較大差異。此外,在腫瘤突變負(fù)荷(TMB)方面,不僅胸腺癌患者TMB明顯高于胸腺瘤患者,男性患者TMB也顯著高于女性。