●導(dǎo)讀●

惡性胸腔積液（MPE）是晚期肺癌患者較為常見(jiàn)的并發(fā)癥之一。臨床上，約在50%的晚期NSCLC患者中發(fā)生，其中在肺腺癌患者中最為常見(jiàn)。肺癌的基因檢測(cè)改變了晚期非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患者的治療和管理模式，但是部分晚期腫瘤患者較難獲取足夠的組織用于分子檢測(cè)，而這時(shí)侵入性較小的液體活檢則是一個(gè)非常好的替代手段。隨著分子檢測(cè)技術(shù)的重大突破，科學(xué)家們已經(jīng)可以用多種液體活檢媒介進(jìn)行基因組信息的探索和研究，其中就包含惡性胸腔積液。

江蘇省常州市第二人民醫(yī)院呼吸與危重癥科 楊明夏主任與允英醫(yī)療合作，利用允英肺癌靶向套餐NGS Panel23對(duì)108例肺癌患者胸水沉淀樣本進(jìn)行了基因檢測(cè)分析，基于允英自主研發(fā)具有更高捕獲效率的AllNGS?技術(shù)，揭示胸水樣本作為液體活檢媒介，可以提供具有代表性的腫瘤基因組信息。相關(guān)研究成果在ONCOLOGY LETTERS上發(fā)表。

● 研究人群 ●

研究共納入了2017年12月至2018年7月期間共108例晚期非小細(xì)胞肺癌患者的胸腔積液樣本；其中腺癌患者占60.1%。

● 研究結(jié)果 ●

1、108例患者腫瘤基因組變異情況

研究在93例（86%）患者檢測(cè)到EGFR突變，其中28例（30%）檢測(cè)到 19號(hào)外顯子缺失突變，33例（35.5%）檢測(cè)到 L858R突變及L861Q突變，7例（7.5%）患者檢測(cè)到T790M突變，其中包含一例T790M與C797S順式突變。

6例（5.6%）患者檢測(cè)到ALK-EML4融合，另外檢測(cè)到1例患者攜帶ROS1-CD74融合；以及2例患者攜帶HER2 M774_A775insAYVM突變。從結(jié)果看，提示超過(guò)60%的肺癌患者通過(guò)胸水樣本分子檢測(cè)可以指導(dǎo)后續(xù)靶向治療。

同時(shí)，在108例患者中，檢測(cè)到KRAS，AKT1，BRAF，TP53，PIK3CA，DDR等基因突變，為肺癌靶向治療藥物開(kāi)發(fā)提供了研究基礎(chǔ)。

2、不同性別腫瘤基因組變異情況

根據(jù)以往研究，EGFR突變偏向發(fā)生于不吸煙的女性患者中。本研究按照入組患者性別分成兩組進(jìn)行基因突變統(tǒng)計(jì)。去除一例胸水樣本缺少性別信息外，51位男性和56位女性患者的突變信息如下圖所示。在ERBB2，EGFR 18號(hào)外顯子突變，ALK融合，ROS1融合以及PIK3CA突變來(lái)看，女性患者的突變率高于男性患者。而在EGFR 21號(hào)外顯子，BIM 2903bp缺失，TP53以及BRAF突變中，男性患者的突變率要高于女性患者。對(duì)于EGFR 已明確突變位點(diǎn)，女性患者（64.3%）突變率高于男性（50.9%）。

3、不同年齡段腫瘤基因組變異情況

不同年齡階段的肺癌患者在驅(qū)動(dòng)基因突變頻率上是否有差異？本研究則探索了不同年齡階段基因突變情況。下圖顯示了不同年齡的突變分布情況。

結(jié)果表明，某些基因突變率隨年齡的增長(zhǎng)而增加，包括ERBB2熱點(diǎn)突變，PIK3CA熱點(diǎn)突變，BRAF熱點(diǎn)突變，EGFR 18外顯子突變，EGFR 21外顯子突變，PTEN突變，FGFR1其他突變，BIM突變，KRAS突變。相反，其他突變率則隨著年齡的增長(zhǎng)而降低，例如PIK3CA突變，EGFR外顯子20熱點(diǎn)突變和ROS1融合。而其他基因，其突變率和年齡沒(méi)有觀察到顯著差異。

● 討論 ●

研究發(fā)現(xiàn)，胸水樣本作為液體活檢新媒介，可以提供具有代表性的腫瘤基因組信息，為臨床治療方案制定發(fā)揮更多潛在的臨床應(yīng)用價(jià)值。但是液體活檢對(duì)于樣本及檢測(cè)技術(shù)提出了更高要求，以降低假陽(yáng)性或假陰性結(jié)果的出現(xiàn)。

本研究應(yīng)用允英自主研發(fā)的雜交捕獲技術(shù)，提高雜交捕獲效率大于65%，性能優(yōu)于常規(guī)商業(yè)試劑盒（安捷倫，羅氏，Illumina）30-50%的捕獲效率；同時(shí)保證測(cè)序深度及測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量，揭示腫瘤基因組變異情況。