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允英出品|NGS-HRD正式上線,雙重驗證,全面評估卵巢癌等患者PARP抑制劑敏感性!
發(fā)布時間: 2022-4-15 10:57:15

允英NGS-HRD

? ?允英NGS-HRD 通過同源重組通路基因檢測與HRD Score聯(lián)合檢測,雙維度相互驗證。

??通過檢測雜合性缺失(LOH)、端粒等位基因失衡(TAI)及大片段移位(LST)綜合得分來評估HRD狀態(tài),同時還提供包括BRCA1/2等HRR相關基因的檢測結果,全面評估卵巢癌等患者對PARP抑制劑的敏感性。


什么是HRD?

??同源重組修復缺陷(HRD,homologous recombination deficiency)會產(chǎn)生特定的,可量化,穩(wěn)定的基因組改變,是一種基因組不穩(wěn)定的狀態(tài),其中包含可被鑒定的基因突變、插入/缺失,以及染色體結構異常,基因拷貝數(shù)變異等。

??發(fā)生HRD的腫瘤細胞不能準確地修復DNA,轉而依賴其他易錯的途徑來修復DNA, 這一缺陷導致基因組疤痕

??常見的基因組疤痕有三種類型:基因組雜合性丟失(LOH, loss of heterozygosity)、端粒等位基因失衡(TAI,telomeric allelic imbalance)和大片段遷移(LST,large-scale state transitions)。通過計算LOH+TAI+LST的分值,進而評估HRD狀態(tài)。



HRR和HRD之間的關系?

??同源重組修復(HRR,homology dependent recombination repair)是一種高保真的修復方式,該過程是一條復雜的信號通路,需要諸多基因參與。BRCA1/2、PALB2、BARD1、BRIP1、RAD51B、RAD51C、RAD51D、ATM、FAAP20、CHEK2、FAN1、FANCE、FANCM等基因統(tǒng)一被稱為HRR相關基因。

??HRR通路基因突變等因素可導致HRD的發(fā)生。

??發(fā)生HRD的腫瘤細胞由于不能準確的修復DNA損傷依賴其他易錯的途徑來修復DNA, 這一缺陷導致基因組疤痕。

??即HRR相關基因突變檢測是從導致HRD的“因”來檢測HRD,基因組疤痕分析則是從HRD引起的“果”來檢測HRD。

為什么要檢測HRD?

??PROfound等多項研究數(shù)據(jù)顯示HRR基因改變可以提示卵巢癌、乳腺癌、前列腺癌、胰腺癌等患者對PARP抑制劑藥物治療的敏感性。

1. 卵巢癌

??HRD檢測可以使卵巢癌患者PARP抑制劑敏感人群從占20%左右的BRCA突變?nèi)巳簲U大到占50%左右的HRD陽性人群。

??PAOLA-1研究顯示,在HRD陽性組(包括BRCA突變的患者)的卵巢癌患者中,奧拉帕利聯(lián)合貝伐珠單抗一線維持治療組的mPFS為37.2個月,貝伐珠單抗單藥治療組mPFS為17.7個月,同時聯(lián)合治療組疾病進展和死亡的風險降低67%。

??國內(nèi)外多個指南建議卵巢癌患者檢測HRD,指導奧拉帕利等PARP抑制劑治療。


2、乳腺癌

??HRD陽性乳腺癌多見于三陰性乳腺癌,BRCA1/2 基因胚系突變是導致乳腺癌 HRD最常見的原因,PALB2的生殖系突變以及BRCA1和RAD51的啟動子甲基化等也會引起HRD。

??TBCRC 048研究顯示PALB2胚系突變(gPALB2,ORR=82%)和sBRCA(ORR=50%)突變的患者中觀察到PARP抑制劑明確的應答。

3、前列腺癌

??美國FDA已批準奧拉帕利用于治療經(jīng)新型內(nèi)分泌治療后進展且攜帶HRR突變的mCRPC患者(ATM、BRCA1、BRCA2、BARD1、BRIP1、CDK12、CHEK1、CHEK2、FANCL、PALB2、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAD54L);批準盧卡帕利治療經(jīng)新型內(nèi)分泌治療和多西他賽化療后進展且攜帶BRCA突變的mCRPC患者。

??PROfonnd研究顯示奧拉帕利顯著改善攜帶HRR基因突變轉移性前列腺癌患者無進展生存期和總生存期。

4、胰腺癌

??美國FDA批準PARP抑制劑奧拉帕利(olaparib)作為接受含鉑一線化療方案至少16周病情仍未進展、攜帶有害或疑似有害胚系BRCA突變(gBRCAm)的轉移性胰腺癌成人患者的一線維持治療。

??既往研究發(fā)現(xiàn),約4-7%的胰腺癌患者攜帶胚系BRCA1/2突變,這些患者對鉑類藥物尤其敏感。

??POLO研究結果顯示奧拉帕利組相比安慰劑組,中位PFS顯著延長(7.4個月 vs 3.8個月,HR=0.53,P=0.0038),疾病進展風險降低47%。


允英HRD檢測項目

允英NGS-HRD 通過同源重組通路基因檢測與HRD Score聯(lián)合檢測,雙維度相互驗證。

??通過檢測雜合性缺失(LOH)、端粒等位基因失衡(TAI)及大片段移位(LST)綜合得分來評估HRD狀態(tài),同時還提供包括BRCA1/2等HRR相關基因的檢測結果,全面評估卵巢癌等患者對PARP抑制劑的敏感性。

HRD狀態(tài)判定:

??允英NGS-HRD項目采用國際HRD評判標準,結合通過生物信息學權威算法,從LOH、TAI和LST三個方面分析樣本DNA同源重組修復缺陷(HRD)情況,統(tǒng)計HRD評分,同時結合BRCA1/2基因的突變情況,最終如果HRD評分大于等于42或者檢出BRCA1/2突變,即認定該患者為HRD陽性,反之則為陰性。


允英NGS-HRD 樣本類型

腫瘤組織(新鮮手術組織/穿刺組織/FFPE腫瘤組織石蠟切片[保存時間一年以內(nèi)])

? 精準指導卵巢癌/乳腺癌/前列腺癌/胰腺癌/PARP抑制劑及鉑類用藥

腫瘤組織(新鮮手術組織/穿刺組織/FFPE腫瘤組織石蠟切片[保存時間一年以內(nèi)])+ 全血(對照血)
? 精準指導卵巢癌/乳腺癌/前列腺癌/胰腺癌/PARP抑制劑及鉑類用藥
? 提供胚系遺傳信息

適用人群

·卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌、乳腺癌患者;

·既往檢測BRCA1/2檢測陰性,尋求PARP抑制劑獲益的患者。

檢測優(yōu)勢

參考文獻:
[1] 中國抗癌協(xié)會腫瘤標志專業(yè)委員會遺傳性腫瘤標志物協(xié)作組,中華醫(yī)學會病理學分會分子病理學組,輦偉奇,等.同源重組修復缺陷臨床檢測與應用專家共識(2021版)[J].中國癌癥防治雜志 2021年13卷4期, 329-338頁, 2021.
[2] Lynparza Phase III PAOLA-1 trial met primary endpoint as 1st-line maintenance treatment with bevacizumab for advanced ovarian cancer [press release]. Kenilworth, NJ: AstraZeneca and MSD Inc; August 14, 2019.
[3] 610O - Final overall survival (OS) analysis of PROfound: Olaparib vs physician’s choice of enzalutamide or abiraterone in patients (pts) with metastatic castration-resistant prostate cancer (mCRPC) and homologous recombination repair (HRR) gene alterations
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