大腸腺瘤性息肉?。ˋPC）基因的功能缺失突變在轉移性結直腸癌（mCRC）中很常見。然而，人們對mCRC中APC特異性突變的特征知之甚少。
近日，允英醫(yī)療攜手上海長征醫(yī)院肛腸外科，借助于允英自主研發(fā)的DNAplus?高效DNA提取技術、AllNGS?精準液相雜交捕獲技術產品Panel-639，繪制了中國人群轉移性結直腸癌（mCRC）的分子特征圖譜，并首次提出APC基因特異性突變是轉移性結直腸癌患者預后分層的重要標志及其潛在的分子機制。相關研究成果“Specific mutations in APC, with prognostic implications in metastatic colorectal cancer”發(fā)布于SCI雜志Cancer Research and Treatment(IF=5.036，DOI: 10.4143/crt.2023.415)，長征醫(yī)院結直腸外科王治國主任、允英醫(yī)療CEO張道允博士及允英醫(yī)療研發(fā)總監(jiān)鞏子英博士擔任共同通訊作者1。
本研究隊列由275名晚期結直腸癌患者組成。入組患者均提供了經福爾馬林固定的石蠟包埋組織和配對血液樣本，使用允英的AllNGS? Panel-639進行了腫瘤發(fā)生、發(fā)展及用藥相關的639個基因的外顯子及部分內含子靶向測序。經過濾胚系突變后，共報告了321個基因上的3012個體細胞突變。最常見的突變類型是錯義突變、移碼突變和無義突變，最常見的突變基因是TP53 (76%), APC (69%), KRAS (46%), PIK3CA (19%), FBXW7 (16%), SMAD4 (15%), LRP1B (14%), KMT2D (9%), BRAF (9%) 和 KMT2C (7%)（如圖1）。
圖1. 275名mCRC患者的腫瘤基因突變圖譜
進一步研究發(fā)現，APC基因 C端和N端突變兩組間的腫瘤突變負荷（TMB）值也存在顯著差異，APC基因C端突變組患者的TMB顯著高于APC N端突變組（P<0.01）。這表明APC特異性突變可能影響免疫治療的療效。
圖2. 中外mCRC患者APC基因特異性突變組之間的TMB比較
為了了解APC特異性突變在中國人群中的臨床意義，我們進行了預后分析，發(fā)現結直腸癌患者伴隨APC N端突變相關的預后顯著優(yōu)于C端突變。說明APC特異性突變是結直腸癌患者潛在的預后分層因子。
圖3. mCRC患者攜帶APC特異性突變的預后比較
為了解釋這種差異背后的可能分子機制，我們進行了腫瘤信號通路相關基因突變分析，發(fā)現RAS/RTK、Wnt和TGFβ信號通路基因在APC C端突變組中的突變顯著高于N端突變組。根據已有的研究表明，這三個通路的改變會促進腫瘤的發(fā)生發(fā)展。這似乎也解釋了APC C端突變相較于N端突變預后差的原因以及TMB差異。
圖4. APC特異性突變組之間腫瘤信號通路突變的比較
綜上，APC特異性突變作為一個新的潛在轉移性結直腸癌患者預后分層因子，其中攜帶APC基因C端突變的mCRC患者預后相對更差，原因可能是這類患者攜帶了更多的RAS/RTK、Wnt和TGFβ這些腫瘤發(fā)展相關信號通路突變。我們的結果為進一步研究mCRC的預后分層和精準治療提供了參考。
參考文獻：
1. Peng, H., Ying, J., Zang, J., Lu, H., Zhao, X., Yang, P., Wang, X., Li, J., Gong, Z., Zhang, D., & Wang, Z. (2023). Specific Mutations in APC, with Prognostic Implications in Metastatic Colorectal Cancer. Cancer research and treatment, 10.4143/crt.2023.415. Advance online publication. https://doi.org/10.4143/crt.2023.415
允英醫(yī)療以長三角區(qū)域為中心，輻射全中國，公司致力于打造癌癥精準診療的新型生態(tài)圈，綜合運用基因突變檢測、基因甲基化檢測、基因編輯重組等生物科技的前沿技術，全方位提供從癌癥早期精準篩查、癌癥靶向用藥檢測、癌癥治療藥物研發(fā)一體化的腫瘤精準醫(yī)學解決方案。目前在上海、浙江及青海共設有三家實驗室。
允英醫(yī)療成立至今，順利通過由國家衛(wèi)健委臨檢中心、國家病理質控中心、美國病理學會等機構組織的室間質評。檢驗能力獲得了美國病理學會PT認證，部分試劑盒通過歐盟CE認證，獲得國家藥品監(jiān)督管理局（NMPA）注冊批準，且生產管理質量體系獲國際ISO13485認證。目前允英已累計為近三十萬例腫瘤患者提供精準檢測服務，為國內腫瘤精準醫(yī)療領域開拓者。同時允英秉承“嚴謹、高效”的理念，堅守分子診斷技術創(chuàng)新與應用探索，為腫瘤精準醫(yī)療與伴隨診斷領域的茁壯發(fā)展貢獻力量。
