小細(xì)胞肺癌(Small cell lung cancer,SCLC)約占全部肺癌患者的15%,但其具有侵襲性強且易轉(zhuǎn)移的特性,導(dǎo)致患者臨床預(yù)后極差,中位生存期不足10個月,5年平均生存率只有3%左右。目前個性化精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)方案較少惠及SCLC患者,傳統(tǒng)放化療藥物依然是臨床不可或缺的治療策略。然而,部分SCLC患者對依托泊苷聯(lián)合卡鉑或順鉑初發(fā)耐藥,這些患者在接受標(biāo)準(zhǔn)一線治療方案后病情可能加速惡化。因此,通過分子檢驗手段主動甄別化療耐藥患者并開展分層管理,對延長患者生存期具有重要意義。
面對該伴隨診斷技術(shù)需求,允英醫(yī)療攜手上海瑞金醫(yī)院、上海長海醫(yī)院開展科研攻關(guān),依托于允英AllNGS? Panel-315一站式檢測平臺產(chǎn)品,借助人工智能機器學(xué)習(xí)隨機森林聯(lián)合支持向量機分類器算法分析,成功證實SDH基因家族突變狀態(tài)對中國人群SCLC患者的化療預(yù)后具有預(yù)測價值。相關(guān)研究成果“SDH mutations, as potential predictor of chemotherapy prognosis in small cell lung cancer patients”發(fā)表于SCI雜志Discover Oncology(DOI: 10.1007/s12672-023-00685-4)。上海瑞金醫(yī)院呼吸與危重癥科項軼主任、上海長海醫(yī)院呼吸與危重癥醫(yī)學(xué)科董宇超主任擔(dān)任本論文通訊作者,允英醫(yī)療張道允博士與鞏子英博士為共同通訊作者1。
本研究排除了病理診斷非SCLC、非局限性惡性腫瘤既往史的患者群體后,共回顧性納入了78名接受4-6個周期的一線標(biāo)準(zhǔn)依托泊苷聯(lián)合卡鉑或順鉑治療方案的SCLC患者。所有入組患者均提供了質(zhì)量合格的石蠟包被腫瘤組織樣本,并使用允英AllNGS? Panel-315產(chǎn)品開展了液相雜交捕獲測序。隨后,依據(jù)患者總生存期(Overall Survival,OS)是否達(dá)到10個月,將患者隊列進(jìn)一步分為預(yù)后好組(OS≥10)與預(yù)后差組(OS <10)。初步針對預(yù)后好隊列與預(yù)后差隊列患者每個基因的突變數(shù)進(jìn)行了聚類分析,結(jié)果并未觀察到基因突變豐度與患者化療預(yù)后間存在統(tǒng)計學(xué)顯著的相關(guān)性或預(yù)測特征。
為了進(jìn)一步深入挖掘兩個隊列間可能存在的潛在分層特征,本研究對預(yù)后好組與預(yù)后差組患者間的所有基因突變使用隨機森林(Random forest,RF)分類器進(jìn)行了篩選,并按照突變對分組的貢獻(xiàn)度進(jìn)行了排序。選取貢獻(xiàn)度最高的前20個突變特征進(jìn)行后續(xù)分析,發(fā)現(xiàn)相較于預(yù)后好組,預(yù)后差組中這些突變出現(xiàn)的頻率更高,并且使用支持向量機(Support vector machine,SVM)算法針對這20個基因建立的預(yù)后預(yù)測模型能夠很好的評估SCLC患者化療響應(yīng)幾率(AUC=0.89)。
有趣的是,所選的20個基因中,SDH家族和其它6個基因在預(yù)后差組患者中突變頻率明顯高于預(yù)后好組患者,且差異具有統(tǒng)計學(xué)顯著性。其中,攜帶SDH家族、PDCD1LG2或STAT3基因突變的患者,其OS明顯短于非攜帶者。
允英醫(yī)療成立至今,順利通過由國家衛(wèi)健委臨檢中心、國家病理質(zhì)控中心、美國病理學(xué)會等機構(gòu)組織的室間質(zhì)評。檢驗?zāi)芰Λ@得了美國病理學(xué)會PT認(rèn)證,腫瘤核心基因檢測試劑盒通過歐盟CE認(rèn)證,獲得國家藥品監(jiān)督管理局(NMPA)注冊批準(zhǔn),且生產(chǎn)管理質(zhì)量體系獲國際ISO13485認(rèn)證。目前允英已累計為近三十萬例腫瘤患者提供精準(zhǔn)檢測服務(wù),為國內(nèi)腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療領(lǐng)域開拓者。同時允英秉承“嚴(yán)謹(jǐn)、高效”的理念,堅守分子診斷技術(shù)創(chuàng)新與應(yīng)用探索,為腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)療與伴隨診斷領(lǐng)域的茁壯發(fā)展貢獻(xiàn)力量。